圍繞GaN類藍色LED的相關專利，大型LED廠商曾在日本以及海外展開過訴訟。1996年日亞化學工業以豐田合成侵犯了該公司專利為由對后者提起訴訟，為了與之對抗，豐田合成也起訴了日亞化學工業，此后便展開了有關侵害專利以及要求對方專利無效的訴訟。不僅針對豐田合成，日亞化學工業還與美國科銳(Cree)，臺灣晶元光電(Epistar)和億光電子(Everlight Electronics)以及韓國首爾半導體(Seoul Semiconductor)等展開了訴訟。

　　訴訟對象也不僅局限于藍色LED，還包括白色LED和GaN類半導體激光器(藍紫色半導體激光器等)。在業界先行量產藍色LED和白色LED的日亞化學工業按照“出售產品但不出售專利”的方針，拒絕提供該公司的專利授權。

　　不過，進入2002年以后，這種狀況出現了很大的改變。日亞化學工業首先開始向西鐵城電子授權提供白色LED的相關專利;2002年6月與德國歐司朗(OSRAM GmbH)及該公司的集團公司就GaN類發光元件的專利簽訂了交叉授權合同;2002年9月結束了與豐田合成持續了6年之久的專利侵害訴訟。2002年10月與美國Lumileds Lighting, LLC(現為飛利浦照明)簽訂了交叉授權合同，同年11月與Cree達成和解，并簽訂了交叉授權合同。由此，以日亞化學工業為核心，豐田合成、歐司朗、飛利浦照明以及科銳等大型LED廠商之間建立了合作關系。

　　進入21世紀后，市場與企業紛爭發生了變化

　　自日亞化學工業1993年上市藍色LED，直至2002年與豐田合成達成和解為止。

　　之后，日亞化學工業與亞洲的LED廠商之間的專利糾紛仍在繼續，不過2009年2月，日亞化學工業與韓國大型LED廠商首爾半導體達成和解，并簽訂了交叉授權合同。